Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd1Q9Z2E2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mbd1Q9Z2E2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms