Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn8Q9Z260 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn8Q9Z260 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn8Q9Z260 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms