Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lgr5Q9Z1P4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgr5Q9Z1P4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms