Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tusc2Q9WVF8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tusc2Q9WVF8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms