Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clcn5Q9WVD4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clcn5Q9WVD4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms