Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms