Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apobec2Q9WV35 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apobec2Q9WV35 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apobec2Q9WV35 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms