Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1a4Q9WV27 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1a4Q9WV27 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp1a4Q9WV27 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms