Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3bgrQ9WUZ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms