Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL5

Pdcd1lg2, Programmed cell death 1 ligand 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pdcd1lg2Q9WUL5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd1lg2Q9WUL5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd1lg2Q9WUL5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms