Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd6ipQ9WU78 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd6ipQ9WU78 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms