Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lemd3Q9WU40 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lemd3Q9WU40 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lemd3Q9WU40 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lemd3Q9WU40 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms