Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Usp18Q9WTV6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Usp18Q9WTV6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms