Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Abcc6Q9R1S7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Abcc6Q9R1S7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms