Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zeb2Q9R0G7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zeb2Q9R0G7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zeb2Q9R0G7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms