Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Lamc3Q9R0B6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Lamc3Q9R0B6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lamc3Q9R0B6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms