Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fhl3Q9R059 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fhl3Q9R059 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fhl3Q9R059 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms