Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AmfrQ9R049 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AmfrQ9R049 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AmfrQ9R049 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms