Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3Q9QZS0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a3Q9QZS0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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