Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms