Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp21Q9QZL6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp21Q9QZL6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp21Q9QZL6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms