Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Copg1Q9QZE5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms