Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnnt3Q9QZ47 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt3Q9QZ47 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnnt3Q9QZ47 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnnt3Q9QZ47 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnnt3Q9QZ47 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt3Q9QZ47 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt3Q9QZ47 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnt3Q9QZ47 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms