Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Map1aQ9QYR6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Map1aQ9QYR6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms