Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmeff2Q9QYM9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmeff2Q9QYM9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms