Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp1Q9QY53 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nphp1Q9QY53 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms