Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pkp3Q9QY23 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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