Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx8Q9QXV1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms