Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip3Q9QXT8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms