Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip4Q9QXN3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms