Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpsf3Q9QXK7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpsf3Q9QXK7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpsf3Q9QXK7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms