Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trp53inp1Q9QXE4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms