Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpc5Q9QX29 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trpc5Q9QX29 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trpc5Q9QX29 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trpc5Q9QX29 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms