Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3a1Q9QX15 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clca3a1Q9QX15 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms