Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdcQ9QW08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdcQ9QW08 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdcQ9QW08 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms