Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk3Q9QUN9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms