Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hdgfl3Q9JMG7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms