Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Crlf1Q9JM58 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms