Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dclk1Q9JLM8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dclk1Q9JLM8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dclk1Q9JLM8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms