Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cabp1Q9JLK7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp1Q9JLK7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp1Q9JLK7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms