Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2l2Q9JLG4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkd2l2Q9JLG4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms