Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms