Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Uchl3Q9JKB1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Uchl3Q9JKB1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Uchl3Q9JKB1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms