Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnga3Q9JJZ8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms