Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrip3Q9JJR9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nrip3Q9JJR9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nrip3Q9JJR9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms