Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Efcc1Q9JJF6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Efcc1Q9JJF6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms