Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MkksQ9JI70 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MkksQ9JI70 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms