Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pus3Q9JI38 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pus3Q9JI38 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms