Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RabggtaQ9JHK4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RabggtaQ9JHK4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RabggtaQ9JHK4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
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