Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod3Q9JHJ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmod3Q9JHJ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmod3Q9JHJ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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